Existence synagogy v Brandýse nad Labem je doložena k roku 1559. Současná synagoga byla vystavěna roku 1829 po jednom z mnoha požárů. Stavitelé použili starší základy i části obvodových zdí hlavního sálu. Nová synagoga byla postavena jako podélná stavba, jež vedle hlavního sálu obsahuje také obecní dům, kde byl příbytek kantora, zimní modlitebna, učebna, kuchyně a vstup pro ženy se schodištěm na galerie synagogy. Hlavní sál je zaklenut nepravou klášterní klenbou a je opatřen dvěma úrovněmi pravoúhlých galerií v klasicistně-empírovém stylu pro ženy a snad také pro sbor. Archeologický výzkum odkryl základy oválné dvoupatrové galerie. Pokus o takovou stavebně náročnější galerii byl nejspíše inspirován významnou Novou synagogou ve Vídni, jež byla zasvěcena roku 1826, tedy jen o rok dříve, než začala přestavba synagogy v Brandýse. Brandýská synagoga měla původně centrálně umístěné pódium pro předčítání Tóry (bima). Na sklonku 19. století byla středová bima nahrazena pódiem se zábradlím, navazujícím bezprostředně na svatostánek ve východní stěně. V padesátých letech 20. století byly zničeny galerie a svatostánek, hlavní sál byl přestropen, vybílen a synagoga sloužila jako skladiště. Rekonstrukce budovy je založena na existujících dokladech původního vzhledu a na archeologickém průzkumu, který odhalil rovněž části původní výmalby, jež byla v rámci rekonstrukce restaurována a doplněna o chybějící úseky. Celkové náklady vynaložené v rámci projektu Revitalizace židovských památek v ČR činí v Brandýse 25 307 000 Kč.